Facebook公式アカウント
第42回日本分子生物学会年会
December 2018
餅を巧みに非対称分裂させて迎春準備
Mochi (rice cake) is indispensable to welcome the New Year in Japan. To use mochi for various purposes such as for food and for ornament, people firstly pound a large mochi and then divide it into small pieces according to the purposes. This process may be similar to that of producing various types of cells from fertilized eggs by asymmetric cell divisions. The woman in the front is dividing a large mochi asymmetrically such that beans that look like Sara (Smad anchor for receptor activation) endosomes and a crescent that looks like Numb (a cell fate-determining factor) are gathered only into the left half. The other woman on the back is preparing a decoration called mochi-bana (rice-cake flower). Note that she is trying to schematize a linage of stem cells and progeny. For drawing this image, we referred to Gonzalez (2015) Nature 528, 196-197, DOI: 10.1038/528196a.
日本の迎春に欠かせないのが餅である。食用や装飾用などさまざまな用途に利用していくために、まずは大きな餅をついてから、目的に応じて小さく分割していく。そのやり方は、細胞の非対称分裂によって受精卵からさまざまな種類の細胞が形成されていく過程に似ているかもしれない。手前の女性は大きな餅を分けようとしているが、ちょうどSara（Smad anchor for receptor activation）エンドソームのような豆粒と、三日月状の運命決定因子Numbのような三日月状の部分が左側の餅だけに非対称に集まるようにしている。奥の女性は餅花を作っているが、幹細胞と子孫細胞の系譜を模式的に表そうとしていることに注意してほしい。作画においてGonzalez (2015) Nature 528, 196-197, DOI: 10.1038/528196aを参考にした。
November 2018
飽和曲線の傾きに合わせて編隊を変える雁
When drawing a saturation binding curve of two proteins, there is a way of plotting the concentration of the free form of one of the pair on X axis, and the ratio of the other that is forming complex on Y axis. In this case, the slope of the curve is small if their affinity is low (i.e. large dissociation constant (Kd)); however, the slope is large if the affinity is high (i.e. small Kd). In this drawing, two flocks of wild geese are flying along two line-shaped clouds that are likened to saturation binding curves. The geese along the lower, gentle-slope cloud are flying apart as if their affinity is low. On the other hand, the ones flying along the steep-slope cloud in front of the moon are gathering together as if their affinity is high. For drawing this image, we referred to the research paper by Sadaie et al. (2014) Mol. Cell. Biol., 34:3272-3290, DOI: 10.1128/MCB.00087-14 that reports in vivo Kd values.
2つのタンパク質間結合の飽和曲線では、X軸に片方のタンパク質の遊離濃度を、Y軸にもう一方のタンパク質が複合体を形成している割合を示すことがある。その場合、両者の親和性が低い（解離定数Kd が大きい）ときは曲線の傾きが小さいが、親和性が高い（Kd が小さい）ときは曲線の傾きが大きい。この絵では、飽和曲線に模した2筋の線状の雲に沿って2つの雁の群れが飛んでいる。下方の、傾きの小さい雲に沿って飛ぶ群れは、まるで互いの親和性が低いように分散して飛んでいる。一方、大きく傾き月の手前を横切っている雲に沿う群れは、親和性が高いかのように互いに密着している。作画にあたり、in vivoでのKd 値を報告しているSadaie et al. (2014) Mol. Cell. Biol., 34:3272-3290, DOI: 10.1128/MCB.00087-14 を参考にした。
